為適應中國建立社會主義市場經濟體制，深化外經貿體制改革和促進醫藥保健品進出口貿易健康發展的需要，它是由國務院對外經濟貿易主管部門及其授權部門批准從事醫藥保健品進出口貿易，在中華人民共和國境內註冊的各類企業依法組成的，進行行業協調，為醫藥保健品進出口企業服務的社會團體。具有獨立法人地位。現有會員1100多家，遍佈全國各地。本會遵守國家法律、行政法規，貫徹執行國家對外貿易方針、政策，接受國務院主管部門的管理、指導和監督。本會的宗旨是 為適應中國建立社會主義市場經濟體制，深化外經貿體制改革和促進醫藥保健品進出口貿易健康發展的需要，中國醫藥保健品進出口商會（CHINA CHAMBER OF COMMERCE OF MEDICINES & HEALTH PRODUCTS IMPORTERS & EXPORTERS）於1989年5月在北京正式成立。
它是由國務院對外經濟貿易主管部門及其授權部門批准從事醫藥保健品進出口貿易，在中華人民共和國境內註冊的各類企業依法組成的，進行行業協調，為醫藥保健品進出口企業服務的社會團體。具有獨立法人地位。現有會員1100多家，遍佈全國各地。本會遵守國家法律、行政法規，貫徹執行國家對外貿易方針、政策，接受國務院主管部門的管理、指導和監督。本會的宗旨是對醫藥保健品進出口經營進行協調，維護對外貿易秩序，保護公平競爭，維護國家、行業利益及會員企業的合法權益，為擴大醫藥保健品進出口貿易服務。
作為行業的組織者，中國醫藥保健品進出口商會的主要職能和主要任務是對會員的對外貿易經營活動進行協調指導，提供諮詢服務；對醫藥保健品的出口發展規劃和進口狀況進行研究，並向政府主管部門提出建議；向政府反映會員企業的要求和意見，對政府制定政策提供諮詢和建議；維護本行業進出口經營秩序和會員企業的利益，根據政府授權或會員企業的共同要求和同行協定，對醫藥保健品進出口價格、市場、客戶等進行協調；協助國務院主管部門指導、監督會員企業依法經營，合法使用進出口配額和許可證，並對配額和許可證管理提出建議；對醫保產品進出口市場、行情、國際貿易有關法規、協定、有關國家貿易限制措施及國際金融、利率、貨幣等進行調查研究，為會員企業提供資訊和諮詢服務；組織會員企業就國外對我國醫藥保健品的反傾銷、反補貼投訴進行應訴工作，對外國醫藥保健品在中國的傾銷或其他不正當競爭行為進行調查，並向政府報告；根據國務院主管部門的授權，負責醫藥保健品進出口配額招標的具體實施工作；組織醫藥保健品進出口交易會、展銷會、博覽會，組織會員出國考察、推銷、訂貨和進行技術交流，協助會員對進出口商品進行宣傳介紹及其他促進對外貿易活動；代表本行業參加國際同行業組織，出席有關國際專業會議，加強與國外同行業組織的聯繫、合作與交流，維護會員企業的正當權益，公正地協調解決會員企業之間的貿易糾紛，協調或組織會員企業聯合對國外的招標專案進行投標；履行國務院主管部門授權或根據會員企業共同要求及同行協定賦予的其他職責。
中國醫藥保健品進出口商會根據自身任務的需要，按不同商品類別下設若干分會和協調小組，分別負責有關進出口商品的協調管理和諮詢服務。商會的日常工作由會長、副會長、秘書長主持。常設辦事機構在北京，下設中藥部、西藥部、法律部、展覽部、資訊部、會員部和辦公室，分別負責處理日常工作的具體事宜。
中國醫藥保健品進出口商會，熱忱歡迎有關國際組織和各國同行業組織，各國醫藥保健品貿易公司與我會加強聯繫，開展國際合作，為國際貿易的繁榮和發展，共同作出積極的貢獻。