第1節 替代醫學的核心問題
第2節 系統醫學及其特點
第1節 替代醫學的核心問題
替代醫學在世界範圍內仍舊無法得到主流機構承認的核心障礙是替代醫學的核心理論體系與現代科學體系無法相融與溝通。
目前，屬於替代醫學的理論體系在世界上有數十種，如：
‧中國傳統醫學（Traditional Chinese Medicine，簡稱中醫）、
‧中國西藏醫學（Chinese Tibetan Medicine）、
‧中國蒙族醫學（Chinese Mongolian Medicine）、
‧印度阿育吠陀醫學（India Ayurvedic Medicine ）、
‧希臘-羅馬-阿拉伯古典醫學（Hippocrates-Galen-Avicenna Medicine System）、
‧歐洲順勢療法（Homeopathy）、
‧日本漢方醫學（Japanese Oriental Medicine）、
‧韓國東方醫學（Korean Oriental Medicine）等等，
這些醫學體系中絕大多數基於其產生於數千年前的古代原始哲學理論，經過長期發展形成各自不同的理論體系和技術方法，但它們都能通過使用天然藥物來治療疾病、維護健康。
在系統學習現代醫學的基礎上，通過深入研究中國傳統醫學、印度阿育吠陀醫學、希臘-羅馬-阿拉伯古典醫學等替代醫學體系，並以系統論、控制論、資訊理論、協同論、耗散結構理論、分形與分維理論、全息生物學理論、混沌理論、生命系統理論等等近年來興起的一組以研究複雜系統現象為特徵的學科作為橋梁，我們構建起一個替代醫學的現代科學解釋體系，這一體系是在現代生物醫學體系基礎上的延伸，但同時也深刻揭示了替代醫學各體系中使用天然藥物（植物、動物和礦物）為何有效這一根本問題。實際上，這一新體系可以被理解為一種整合醫學體系（Integrative Medicine），我們稱之為系統醫學（Systematic Medicine）。 ＴＯＰ
第2節 系統醫學及其特點
作為一種整合醫學體系，與目前存在的各種醫學體系相比，系統醫學具有如下的重要特徵：
1、系統醫學是對現代西方醫學理論體系和替代醫學理論體系的發展
系統醫學理論並不是對現代西方醫學理論體系和替代醫學理論體系的否定，而是它們兩者的繼承和發展。在現代生物醫學理論的基礎上，通過對各類替代醫學理論的研究，將現代生物醫學體系的科學理論和替代醫學中的合理成分通過系統科學相結合，發展出系統醫學理論。
2、系統醫學具有先進性和科學性
系統醫學建立於系統科學理論的基礎之上，從系統的角度來研究人體和人體在疾病狀態時的結構與功能的變化，因而奠定了系統醫學理論的先進性和科學性。
3、系統醫學的認識層次
系統科學理論對物質的認識層次，可以分為3個方面：
第一認識層次--對物質宏觀屬性的認識，宏觀屬性是人類可以不借助複雜儀器而能直接感知到的物質的特徵、情況或屬性，如對人體的宏觀屬性就包括體形、體溫、面色、心跳速度、體重、呼吸頻率、行為、自我感覺等等 。在醫學方法中，中國傳統醫學、印度阿育吠陀醫學等傳統醫學體系基本上都是通過對人體宏觀屬性的把握來進行醫學實踐的。
第二認識層次--對物質微觀屬性的認識，微觀屬性是人類需要借助儀器才能觀察、感受到的物質特徵或屬性，如人體的細胞結構、血液中的白細胞數目、侵入人體內的細菌形狀、心臟的電流活動情況、肺內的腫塊等等，均必須通過一定的儀器（如顯微鏡、X線掃描器等）才能觀察或感知到，這也是現代西方醫學賴以發展的基本觀察層次和與傳統醫學的在認識方法上的根本區別。
第三認識層次--對物質高級屬性的認識，物質的高級屬性，也可稱為物質的綜合屬性，現代科學的發展已揭示人體還存在著一些高級的複雜的特徵，如人體的分維數、熵值等等，目前對這些高級屬性的認識尚很少，這裏不作進一步討論。
因此，從系統認識的角度，醫學應當是從上面的三個方面去認識人體，才能獲得對人體的完整準確的認識，從而得到最好的實踐效果。但是，目前現存的絕大多數醫學體系都未能從上述3個層次去認識人體，因此這也就決定了它們必然存在著許多難以克服的缺陷和問題。
4、系統科學的簡單性
越是本質的東西，就越是簡單。
系統醫學是在系統的角度，通過對人體結構與功能這樣的基本層次的研究，得到了數條簡單的系統醫學基本核心原則，這數條核心原則概括了醫學診斷原理、醫學治療原理和藥物原理。
從某個角度，世界上各種不同的醫學，實質上是各種不同的針對人體疾病的如何使用藥物及其它手段的方法。如中國傳統醫學就是通過以陰陽五行原理為基礎的指導如何應用天然藥物及其它方法的一門學科。
從最簡單的藥物治療的角度，這些不同的醫學體系代表了不同的藥物使用方法。
在本文中，我們講述的主要是關於使用天然藥物及化學合成藥物治療疾病方法，對於手術、針刺等等其他的治療手段，我們只予以一般原理性的討論。
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