經鼻持續氣道正壓通氣及手術是目前治療睡眠呼吸暫停綜合徵的最主要的兩種辦法，可惜手術療效有限，而且如何才能讓患者長期堅持應用持續氣道正壓通氣也是一個問題。所以人們一直在想，如果能夠有藥物來替代這兩種辦法，不是更好嗎?遺憾的是，時至今日，還沒有這樣的藥物問世，不過也確有一些藥物對某些特定的睡眠呼吸暫停綜合徵患者具有一定療效。
藥物主要是通過改變睡眠呼吸暫停綜合徵患者的睡眠時相、改善患者的呼吸控制功能來減輕睡眠呼吸暫停的病情的。
1‧有些患者的睡眠呼吸暫停主要發生在REM睡眠期，我們可以通過縮短REM睡眠期來減少睡眠呼吸暫停的次數。
2‧呼吸控制功能低下可以引起睡眠呼吸暫停甚至白天的通氣降低，可以通過刺激呼吸中樞達到治療目的。
3‧女性在更年期以後，睡眠呼吸暫停的發生率上升、病情加重，這時，給患者補充孕激素有助於減輕呼吸暫停。
4‧能夠使患者減肥的藥物，有利於改善睡眠呼吸暫停綜合徵的病情。
下面介紹幾種對睡眠呼吸暫停有治療作用的藥物：
1‧對於與內分泌疾病有關的睡眠呼吸暫停：甲狀腺功能減退引起的睡眠呼吸暫停須服用甲狀腺激素，前面已詳細談過，有的人發現口服孕激素對改善甲狀腺功能減退者夜間睡眠時的呼吸功能也有好處。
與肢端肥大症有關的睡眠呼吸暫停，如不能通過手術治療肢端肥大症，經過應用生長激素的抑制劑，有可能減輕睡眠呼吸暫停。
2‧呼吸控制功能異常引起的睡眠呼吸暫停：
(1)乙 唑胺：它主要通過抑制腎臟排出氫離子，從而使血液的酸度增加，腦血管擴張，刺激呼吸中樞活動，增強呼吸驅動功能而減少睡眠呼吸暫停。對阻塞型睡眠呼吸暫停綜合徵的效果不好，對中樞型睡眠呼吸暫停似乎更有效。它的主要副作用是可以引起感覺異常及電解質失衡，每天用量為250～500毫克。
(2)安宮黃體酮：它可以刺激人的呼吸中樞，每天服用60毫克，正常人在48小時之內即可出現過度通氣、呼吸性鹼中毒，特別是在運動時，這種作用表現得更明顯。對白天通氣不足的睡眠呼吸暫停綜合徵患者有效。副作用有性欲減退、水腫、血栓形成、高血壓。用量20～40毫克，每日3次。
(3)茶鹼類藥物：靜脈應用，對中樞型睡眠呼吸暫停綜合徵患者有效，但患者的睡眠質量更差；對阻塞型睡眠呼吸暫停綜合徵患者無效。
3‧大腦皮層興奮劑及阿片類受體阻斷劑：有人發現阻塞型睡眠呼吸暫停綜合徵患者的腦脊液中，阿片類物質增加，因而推測應用阿片製劑的拮抗藥物，可能對阻塞型睡眠呼吸暫停綜合徵有好處。納洛酮被應用於少數病例中，但效果難以肯定。
動物實驗發現，煙鹼可刺激上氣道的肌肉而引起上氣道阻力降低。人在睡覺前咀嚼含煙鹼的口香糖可以使入睡後2小時內呼吸暫停的發生率下降，但這種作用持續的時間較短。
4‧開博通：是常用的降壓藥物，有一組報告發現，對有高血壓的阻塞型睡眠呼吸暫停綜合徵患者，開博通不僅可以降低血壓，還可以使睡眠呼吸暫停的次數降低。
5‧作用於精神系統的藥物：普洛替林是一種非成癮的抗抑鬱症的藥物，每天口服10～20毫克，可以減輕部分睡眠呼吸暫停綜合徵患者的病情，表現為缺氧改善、白天嗜睡減輕。但短時間內應用效果不明顯。有的人還發現在服用普洛替林後，再應用持續氣道正壓通氣治療時，需要的壓力降低，故有人主張在應用持續氣道正壓通氣治療睡眠呼吸暫停綜合徵的同時口服普洛替林。該藥的主要副作用為口乾、尿瀦留、心律失常、性欲減退。
病人及醫生都希望能應用藥物來治療睡眠呼吸暫停綜合徵，以期藥到病除。遺憾的是，到目前為止，還沒有一種藥物對睡眠呼吸暫停綜合徵患者肯定有效，文獻報導中的病例，無嚴格的對照，缺少多中心、大量病例研究的結果。所以目前藥物治療不是睡眠呼吸暫停綜合徵的主要治療手段。但根據病人的具體情況，選用一些副作用小的藥物，可以作為輔助治療睡眠呼吸暫停綜合徵的手段之一。
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