魚種 | 備註 |
| 海荷鯨 Spratell oides gracilis（俗名丁香魚） | 是石滬漁獲中最主要斤以上的紀錄。 |
| 印度小公魚 Stolephorus indicus（俗名魚堯仔） | 亦為石滬主要漁獲，市價較丁香為低。 |
| 臭肉塭 Etrumeus terres（俗名臭肉） | 每年4-9月為大產期。 |
| 里尾砂魺 Sardinella melanura（俗名青鱗） | 每年7-12月為大產期。 |
| 中華鰆 Scomberomorus sinensis（俗名梳齒，大耳） | 每年11-12月為主產期。 |
| 巴鰹 Euthynnus affinis（俗名花煙） | 5月產卵，夏季漁期。 |
| 紅甘魚參 Seriola dumerili（俗名紅甘、竹午） | 鳥嶼新滬房20年前曾有千斤竹午的紀錄，是石滬最重要的經濟魚種。 |
| 銅鏡魚參 Decapterus maruadsi（俗名巴攏） | 春夏兩季產量較多，吉貝西崁瀨滬有過大漁獲。 |
| 臭肚魚 Siganus fuscescens（俗名象耳、羊尾魚種） | 雜食性，有24枚硬棘具毒，為入滬經常性的魚種，冬季較多。 |
| 鮸魚 Argyrosomus japonica（俗名鮸） | 產於沙泥質底海域，肉富彈性，秋季脂肪多味道最美，為入滬魚種中的高級魚。 |
| 斑都鮭 Leiognatus bindus（俗名兵葉仔） | 經濟價值不高，飼料為其主要用途。 |
| 拉洋魚參 Decapterus macarellus | 民國65年吉貝內滬曾有萬斤四破的記錄。 |
| 三線雞魚 Parapristipoma trilineatum（俗名雞魚） | 湖西東旁滬、吉貝倒塞仔滬都有過大量漁獲。 |
| 花身雞魚 Terapon jarbua（俗名邦伍） | 屬熱帶肉食性，常出現於淺灘，鰓蓋具突刺，肉味美。 |
| 四線雞魚 Pelates quadrilineatus（俗名花身仔） | 後寮沙滬角、長岸尾滬有過大量漁獲。 |
| 扁鶴魚箴 Ablennes hians（俗名學仔，或稱圓學） | 熱帶肉食性魚類，吻長兇猛，經濟價值較低，吉貝西角坪仔大量捕獲。 |
| 斑魚箴 Hemiramphus far（俗名水針） | 為熱帶草食性，夏秋多產。吉貝、南寮、紅羅多產。 |
| 奧奈鑽嘴 Gerres oyena（俗名垵米） | 龍門垵米滬因多產此魚而名，體色銀白。 |
| 雙帶鳥尾冬 Pterocaesio digramma（俗稱鳥尾冬魚種） | 3-9月為大產期，西衛滬常有斬獲。 |
| 大鱗鰡 Liza macrolepis（俗名小腦，粗鱗烏仔） | 一年四季均有，冬至後最多，常在淺灘出現，龍門有烏仔滬。 |
| 白帶魚 Trichiurus japanicus（俗名白帶） | 1-3月多產豐肥，風櫃的鹽孔滬曾大量捕獲。 |
| 六班刺河魨 Diodon holocanthus（俗名刺魚規魚種） | 去棘後可食用，湯頗腥濃味美。 |
| 南洋銀漢魚 Atherinomorus lacunosus（俗名定鱗） | 春夏較瘦秋後轉肥，南寮白沙滬大量漁獲。 |
| 鰻鯰 Plotosus lineatus（俗名沙毛） | 口鬚三對，具二枚毒棘，夜行性，白天遇險則聚成「鯰球」，安宅頂滬，湖西蔥滬曾獲。 |
| 青嘴龍占 Lethrinus nebulosus（俗名青嘴仔） | 幼魚常出現於沿海礁棚，二崁滬經常捕獲，沙港有一口青嘴溝滬即以此魚命名。 |
| 扇魷 Sepioteuthis lessoniana（俗名柔魚） | 魷科，全年皆產，據赤崁漁民說法以九月份較肥，味道鮮美，為冬季石滬的主要魚種。 |
| 甲殼烏賊 Sepia pharaonis（俗名墨魚則） | 花枝，9-12月為大產期，農曆1-2同為產卵期。 |
| 玳琩石斑 Epinephelus quoyanus（俗名繪仔） | 屬石滬內的底悽性魚種，漁民在滬內設「墩」圍捕，或在滬岸上以竿釣取，價高湯味美。 |
| 蘭勃鮀魚 Kyphosus lembus（俗名開基） | 主產於夏季，經常見於石滬中或定置網內。 |
| 光鰓雀鯛 Chromis notata（俗名厚殼仔） | 屬石滬內常駐底棲性魚種。大池角有二口滬名為內、外 厚殼，即以多產此魚而名。 |
| 六線雀鯛 Abudenfduf coelestinus （俗名花翎仔 、加撥婆） | 為石滬中常駐性魚種。常棲守於礁岩間。 |
| 鯙類（俗名錢鰻） | 為珊瑚礁海域中生性兇猛的肉食性魚，也常穴居於滬房、伸腳的玄武岩壁中，漁民覘誘捕之。 |
| 魟類（俗名魴仔、魴、燕仔） | 體廣扁平，鰭展如翼，尾尖劇毒，號稱海中第一毒魚，常隨潮水入滬。 |
| 鯊魚類（俗名沙魚，白眼鮫科） | 田野調查紀錄中，有近20口滬有鯊魚入滬。大盤洋、西坪口有鯨魚入滬記錄。 |
| 海龜類 | 入滬者泰半為小海龜。講美深滬，沙港石滬常遇此種狀況。 |